ในปี  2553 มหาวิทยาลัยฯ ได้จัดสรรงบประมาณ เพื่อพัฒนาสนามกีฬาของวิทยาเขตหาดใหญ่ จำนวน  472.5 ล้านบาท  เพื่อเตรียมการจัดการแข่งขันกีฬามหาวิทยาลัยแห่งประเทศไทย
ครั้งที่ 39  พ.ศ. 2555 ตลอดจนรองรับการส่งเสริม ทางด้านการกีฬาให้กับนักศึกษา  บุคลากร และ บุคคลทั่วไป

โดยการก่อสร้างอาคารศูนย์กีฬาและสนามกีฬาเพิ่มเติม รวมทั้งปรับปรุงสนามกีฬา เดิมการบริหารสนามกีฬาอยู่ใน
ความรับผิดชอบของ งานพัฒนากีฬา กองกิจการนักศึกษา มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ วิทยาเขตหาดใหญ่ ประกอบกับการส่งเสริมกิจกรรมกีฬา ในมหาวิทยาลัยฯ มีหลายหน่วยงานร่วมรับผิดชอบ

ดังนั้นคณะกรรมการบริหารการกีฬา วิทยาเขตหาดใหญ่ จึงมีมติให้เสนอโครงการจัดตั้งศูนย์พัฒนากีฬาและสุขภาพ วิทยาเขตหาดใหญ่ ขึ้นมาเพื่อทำหน้าที่ส่งเสริมกิจกรรม ด้านการพัฒนาการกีฬาและส่งเสริมกีฬาเพื่อสุขภาพ และดูแลอาคาร สนามกีฬาของ ศูนย์กีฬาฯ ของมหาวิทยาลัย ทั้งระบบ ตลอดจนทำหน้าที่ประสานหน่วยงานที่เกี่ยวข้องด้านการกีฬา ทั้งในวิทยาเขตและต่างวิทยาเขต ให้เป็นไปในทิศทางเดียวกัน

ทั้งนี้ที่ประชุม workshop ทีมบริหาร ในวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2556 ได้พิจารณา เรื่องโครงการจัดตั้งศูนย์กีฬาฯ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ วิทยาเขตหาดใหญ่ มีมติเห็นชอบในหลักการให้มีการจัดตั้งศูนย์ พัฒนากีฬา โดยให้เป็นหน่วยงาน ภายใต้การกำกับของมหาวิทยาลัย และในวันที่ 1 กันยายน 2557 มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ ได้ประกาศจัดตั้งศูนย์กีฬาและสุขภาพ เป็นหน่วยงานภายใน สังกัดสำนักงานอธิการบดี ต่อมาเมื่อวันที่ 17 กรกฎาคม 2563 ที่ผ่านมา มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ได้มีประกาศ การแบ่งโครงสร้างหน่วยงานภายในของส่วนงานประเภทนโยบายและบริหารของมหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ โดยศูนย์กีฬาและสุขภาพ วิทยาเขตหาดใหญ่ อยู่ภายใต้การกำกับดูแลของสำนักงานวิทยาเขตหาดใหญ่